| マルチ・ドナー・キメラ現象の定量的モニタリング：ルーチン分析に対する系統的、認められたフレームワーク 「治療的な利点にもかかわらず、二重ドナー（DD）HSCTは、モニタしている分子キメラ現象（ChM）のために、技術的問題を示す。これらのDDキメラは3つのマッチされたDNAを含む、そのため、提供者とレシピエントのゲノムはしばしば同じアレルを共有する。STR分析法では、共有レシピエント/提供者アレルは、一般的で、同一の物理化学的性質を持つ。後者の結果として、彼らは同じ帯（『共有ピーク』）で共同移住する。そして、それは別に各アレルを測定するのを妨げる。個々の対立形質の測定なしで、キメラのレシピエント/提供者DNA比率の直接の算出は、排除される。これは、文書化して、系統的にこれらの問題を検討する第1の検査である。その目的は、認められたフレームワークを共有STR-アレルからパーセントChM（%CHM）に近づくために段階的分析的パラダイムに基づく正確な、日常的なモニタリングに提供することになっていた。DD座からのSTR-DNAの分析法は、6つのアレルのうちの少なくとも4つが典型的に共有されることを示した。分担しているそのような広範囲な対立遺伝子にもかかわらず、我々は単純な算数処置がどのようにピークの測定に基づく%CHMの標準化された算出のために適用されることができるかについて教える。そのような分析にふさわしい座を選択するための基準は、提供される。計算結果の確証は、%CHMのために予定された基準値で18の『有益な』座を分析することを必要とした。全ての場合において、%CHM（ピークの測定から算出される）のための結果は、基準値の+/-5%であった。本研究の終結は、以下の通りである：(1)マルチ移植用提供キメラは、共有アレルで、STR測定誤差の通常の範囲の範囲内で、正確に、そして、簡単に分析されることができる;(2) DD ChM分析のこれらのさまざまな側面を検討することによって、この新規検査は、基礎を、2009年6月8日に、STR/VNTR assay.Bone髄移植前進オンライン刊行を使用している標準化された、日常的な定量的モニタリングに提供した;doi：10.1038/bmt.2009.120。」 Quantitative monitoring of multi-donor chimerism: a systematic, validated framework for routine analysis. Despite therapeutic advantages, double-donor (DD) HSCTs present technical problems for molecular chimerism (CHM) monitoring . These DD chimeras contain three matched DNAs, so that the genomes of donor(s) and recipient often share the same alleles . In the STR assay, shared recipient/donor alleles are common and have identical physico-chemical properties . As a consequence of the latter, they co-migrate in the same band ('shared peak'), which prevents measuring each allele separately . Without individual allelic measurements, the direct calculation of the chimeric recipient/donor DNA ratio is precluded . This is the first study to document and systematically examine these problems . Its goal was to provide a validated framework for accurate, routine monitoring based on a stepwise analytic paradigm for approximating percent CHM (%CHM) from shared STR-alleles . Analysis of STR-DNA from DD loci showed that at least four of six alleles were typically shared . Despite such extensive allelic sharing, we show how simple arithmetic procedures can be applied for standardized calculation of %CHM based on peak measurements . Criteria for selecting loci suitable for such analysis are provided . Validation of the computational results required analyzing 18 'informative' loci with pre-established reference values for %CHM . In all cases, the results for %CHM, calculated from peak measurements, were +/-5% of the reference value . The conclusions of the study are as follows: (1) Multi-donor chimeras, with shared alleles, can be accurately and simply analyzed within the usual limits of STR measurement error; (2) by examining these various facets of DD CHM analysis, this novel study has provided a basis for standardized, routine quantitative monitoring using the STR/VNTR assay .Bone Marrow Transplantation advance online publication, 8 June 2009; doi:10 .1038/bmt .2009 .120 . Reference: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/, PMID:19503109 |