【ストーリー】
4年前の1995年、ガメラとギャオスの戦いで両親を失った綾奈は、今は弟と奈良県南明日香村の親戚の家で暮らしていた。彼女のガメラに対する憎悪は膨らむ一方で、そんな中、彼女は伝説の神獣「柳星帳」が眠る祠の封印を解いてしまう。ある日、渋谷にガメラとギャオスが出現した。激しい戦いの末、渋谷は壊滅する。テレビで見ていた綾奈は、ガメラに対する憎しみを強くする。綾奈が封印を解いた祠で、奇妙な生物が覚醒した。綾奈はイリスと名づけ育てる。ところが、綾奈はイリスの繭に取り込まれてしまった。クラスメイトの龍成のお陰で病院に運ばれ一命を取り留めるも、成長したイリスは村人を襲い巨大化していく。一方、鳥類学者の真弓は、明日香村で起こった事件を聞きつけ、大迫元警部補とかつてガメラと心を通わせた浅黄と奈良に飛んだ。調査を進めていくうち、どうやらギャオスの変異体の生物が現れたことをつきとめる真弓。そして、その誕生に綾奈が拘わっていることを知った彼女は、綾奈が入院している病院へ急行する。ところが、綾奈が病院から姿を消してしまう。内閣情報調査官の朝倉が彼女を京都へ移したのだ。京都に向かう真弓と浅黄。そんな彼女たちの前に、ゲーム作家の倉田が現れ、イリスは綾奈と融合するつもりだと告げた。そしてついに、イリスが京都に現れた。綾奈を探して、京都を破壊するイリス。しかし、そこへガメラが登場。イリスと死闘を繰り広げる。
観るべ（＾＾）