第16戦マレーシアGPの決勝レースは25日、セパンで行われ、フリアン・シモンが優勝。今季6勝目を飾った。
気温33度。路面温度48度のドライコンディションの中、2ラップ目にトップに立った2番グリッドのフリアン・シモンは、公式予選の転倒で右足を骨折した3番グリッドのブラドリー・スミスと、2戦連続して優勝争いを展開。1.114秒差で競り勝ち、新王者の貫禄を見せた。
グループによる3位争いは、朝のウォームアップ走行を制した5番グリッドのポル・エスパルガロが競り勝ち、セルジオ・ガデア、ニコラス・テロール、サンドロ・コルテセ、エステベ・ラバット、アンドレア・イアンノーネ、ジョアン・オリベが続いた。
ウォームアップ走行で転倒を喫した中上貴昌は、17番グリッドからチームメイトのロレンソ・サネティとのバトルを展開。僅少さで11位だった。
3位争いを展開していたポールポジションのマルク・マルケス、ジョナス・フォルガー、エフレン・バスケス、シモーネ・コルシはリタイヤ。26番グリッドの小山知良は、オープニングラップで21番手に浮上したが、3ラップ目にリタイヤした。
チャンピオンシップは、5戦連続8度目の表彰台を獲得したスミスのランク2位が決定。ランク3位のテロール、ランク4位のエスパルガロのポイント差が15に接近した。
| 1 | 25 | 60 | Julian SIMON | SPA | Bancaja Aspar Team 125cc | Aprilia | 42'50.916 | 147.606 | |
| 2 | 20 | 38 | Bradley SMITH | GBR | Bancaja Aspar Team 125cc | Aprilia | 42'52.030 | 147.542 | 1.114 |
| 3 | 16 | 44 | Pol ESPARGARO | SPA | Derbi Racing Team | Derbi | 42'57.209 | 147.245 | 6.293 |
| 4 | 13 | 33 | Sergio GADEA | SPA | Bancaja Aspar Team 125cc | Aprilia | 42'58.919 | 147.148 | 8.003 |
| 5 | 11 | 18 | Nicolas TEROL | SPA | Jack & Jones Team | Aprilia | 42'59.401 | 147.120 | 8.485 |
| 6 | 10 | 11 | Sandro CORTESE | GER | Ajo Interwetten | Derbi | 43'01.104 | 147.023 | 10.188 |
| 7 | 9 | 12 | Esteve RABAT | SPA | Blusens Aprilia | Aprilia | 43'06.030 | 146.743 | 15.114 |
| 8 | 8 | 29 | Andrea IANNONE | ITA | Ongetta Team I.S.P.A. | Aprilia | 43'13.067 | 146.345 | 22.151 |
| 9 | 7 | 6 | Joan OLIVE | SPA | Derbi Racing Team | Derbi | 43'17.304 | 146.106 | 26.388 |
| 10 | 6 | 8 | Lorenzo ZANETTI | ITA | Ongetta Team I.S.P.A. | Aprilia | 43'18.029 | 146.065 | 27.113 |
| 11 | 5 | 73 | Takaaki NAKAGAMI | JPN | Ongetta Team I.S.P.A. | Aprilia | 43'18.775 | 146.023 | 27.859 |
| 12 | 4 | 88 | Michael RANSEDER | AUT | CBC Corse | Aprilia | 43'25.754 | 145.632 | 34.838 |
| 13 | 3 | 35 | Randy KRUMMENACHER | SWI | Degraaf Grand Prix | Aprilia | 43'32.745 | 145.243 | 41.829 |
| 14 | 2 | 77 | Dominique AEGERTER | SWI | Ajo Interwetten | Derbi | 43'33.349 | 145.209 | 42.433 |
| 15 | 1 | 39 | Luis SALOM | SPA | Jack & Jones Team | Aprilia | 43'42.551 | 144.700 | 51.635 |