ヤマトは ズオーダー大帝率いる白色彗星帝国との闘いで 徳川彦衛門 加藤三郎 山本明 斉藤始 を はじめとする 多大なる犠牲者を 出し 奇しくも 勝利を 納めた。その１ヶ月後 ガミラス帝国の デスラー総統 の 故郷 ガミラス星で 暗黒星雲団 の 船団 が 資源強奪 を行っていた。ガミラス船団 と 暗黒星雲団 の 一騎打ち で ガミラス星は 大爆発。その余波 で 互いに引き合う重力を 無くした イスカンダルは スターシャ 古代守 娘の サーシャを 乗せたまま 暴走を 始める。イスカンダルを 追う デスラー総統の船団。その頃 古代進たち ヤマト乗組員は 新しい 宇宙訓練学校の卒業生たちを 乗せて 宇宙演習に 飛び立った。今回は 今まで 敵同士 好敵手だった 古代進 と デスラー の 互いに スターシャ 守 サーシャ の ために 手を取り合う姿 が 印象的だ。ラスト 娘のサーシャ が 母親スターシャの面影を 追って 泣き叫ぶシーン は 心に 刺さる。