はじめに 当記事は地球防衛軍６のネタバレと、推測で構成されています。
それらが不快に感じる方は読まないようお願い申し上げます。
なお、考察の際には動画や攻略サイトに掲載されている意見も参考にしました。
面倒なので、考察元の詳細は省きます。
最後に、この考察のほとんどは妄想と呼べるものです。
書いといてなんですが、こんな風に考えた人がいる、程度にして、
鵜呑みにしないようお願い申し上げます。
訪問者無限ループの可能性。
考察：訪問者で過去改変が成功した際、次の「訪問者」で再度「同じ改変船団」が送られなければ矛盾する。
同時に、「訪問者」で飛ぶ前の時間軸に帰還することも矛盾するため、改変船団帰還のための手順でもあるのでは。
プロフェッサー「最初の一回はおそらく～」
確定事項：このセリフより、『最初の一回』の記憶はない。
考察：ゲームで描かれないためストーム1の記憶にもない可能性が高い。
改変について
最初をＥＤＦ：０回目として、以後、訪問者～翌日の改変をＥＤＦ：（ｎ）Ｐ、
プロフェッサー、ストーム1のタイムリープによるＥＤＦ6以降をＥＤＦ：（ｎ）Ｓと表記すると、
ＥＤＦ：１回目Ｐで改変されたあとの歴史から、プロフェッサーたちの記憶に残っていると推測。
考察：時間に干渉しないと、あるいは直接改変を行った当事者、ワープなどの要因がないと上書きされてしまう可能性が高い。
ストーム１に訪問者で改変された記憶はあるのか。
考察：ゲーム上で徹底して省かれているため、記憶はないのではないか。
プロフェッサーの記憶は？
プロフェッサーが「戦術航空作戦」の時点で「怪物は未来の地球生物」と発言。
改変後、ミッション１１１の「翌日」で「まさか、未来の地球の生物なのか？と発言。
これによりプロフェッサーは「タイムリープしたという記憶は持っているがＥＤＦ（ｎ）Ｐの記憶を持つ」とわかる。
つまり、プレイヤーの見てきた訪問者までの部分と、プロフェッサーの記憶は違うことになる。
考察：ストーム１の記憶＝プレイヤーのミッションの場合
タイムリープから「訪問者」までの経験を覚えており、翌日までの過去改変の影響を受けない。
確定事項：プロフェッサーの記憶は、くだんの日でタイムリープするが、「訪問者」で送られた過去改変船団の影響を受ける。
つまり、ストーム1が過去改変した「訪問者」までの記憶（ＥＤＦ：ｎ回目Ｓ時間軸）がなく、
改変船団による改変～「翌日」までの記憶（ＥＤＦ：ｎ回目Ｐ時間軸）をもって生きている。
考察：十字マークについて。
ベース２５１、くだんの日にだけつく十字マーク。
ベース２５１についてはミッション1段階では「通信が取れない2人の合流地点」である。
くだんの日は次のループへの出発地点である。
ところでこの十字マーク。 くだんの日で壊す制御装置も同じ形をしているのだが・・・。
これは周回ではなくてタイムリープした回数（周回+１）なのではないだろうか。
ミッション？？？について
考察：ストーム1の記憶がプレイヤーと同じと仮定して、ストーム1の記憶にない時間軸だから数字がないのでは。
簡潔に言うなら、改変船団の改変、およびプロフェッサーたちが持つ『ＥＤＦ：ｎ回目Ｐ』の時間軸ではないか。
出現時期がマーク9個付き（本考察での9回タイムリープ後、ＥＤＦ：９回目Ｓの時間軸）のため、
順序的に「ＥＤＦ：10回目Ｐの時間軸」で、改変に失敗したのではないか。
ストーム１の記憶は？その２
考察：上記の仮定から推察すると、ストーム１の記憶はミッションナンバーが振られているもの。
それ以前も訪問者→翌日であったことから考えて、
１３７「訪問者」→１４４「翌日」なのではないだろうか？
考察２：一方で、プロフェッサーたちは？
そしてプロフェッサー、およびほかのＥＤＦメンバーは？？？の部分を覚えていて、
１３７～１４４の間に来る「訪問者」相当の時間軸で、『これから過去で倒す改変船団』を見送ったのでは。