AMIを削除する方法は、AMIを選択して、 Deregister を選択するだけかと思っていたが、
そうではなかったので、メモしておきます。
AMI の登録解除
http://docs.aws.amazon.com/ja_jp/AWSEC2/latest/UserGuide/deregister-ami.html
Deregisterをしただけでは、取得したsnapshotが残っている状態なので、
そのあとにAMI IDでsnapshotを検索して、snapshotも削除しないと余計な課金が
発生してしまいます。
AMIの登録を解除したら、一緒にsnapshotも削除されるオプションがあるといいですね。