以下ググっても検索できなかったので書いておきます。
私は最近yahooモバゲー（ＰＣ版）を始めたiPhoneユーザーです。（一般携帯は持っていない）
そのため、ケータイ版モバゲーはやっていなかったのですが、2010/12/15にスマートフォン版のモバゲーがリリースされたようです。（http://dena.jp/press/2010/12/dena-16.php ）
そこでyahoo版とスマートフォン版を連携させようとしたのですが、この方法がまだあまりシンプルとは呼べなそうなので下記します。(iPhoneユーザーでもし困っている方がいらっしゃったら参考としてみてください。）
前提条件：yahooモバゲーに登録している、ケータイ版モバゲーに登録していない、iPhoneを持っている
（※以下の操作は全てiPhoneによる操作です、青字部分はアプリ名）
１．設定：yahooモバゲーに登録したメールのアカウントを設定画面から追加する（やり方が分からない場合はこちらを参照して下さいhttp://support.apple.com/kb/HT1385?viewlocale=ja_JP&locale=ja_JP ）
２．safari：モバゲー for Smartphoneのページにアクセスする（http://mbga.jp ）
３．safari：ログインページが自動で開く
４．safari：ケータイ版データの共有・引き接ぎを開く
５．safari：ページ内で(1)～(4)の設定が表示されるのでこのうち(2)：ログインパスワードを設定するを選択する（ケータイ版で設定したメールアドレスを・・・と記載されていますが、無視して下さい）
６．safari：メールアドレスの入力を迫られるので１項で設定したyahooモバゲーのメールアドレスを入力して送信ボタンを押す
７．メール：１項で設定したyahooモバゲーのメールアドレスにメールが届くので「スマートフォンからアクセスする場合はこちら」という方のURLを開く
８．safari：yahooモバゲーで設定した生年月日を入力し、ログインパスワードを新規設定する
９．safari：電話番号を入力し、SMSの送信を行う
１０．SMS/MMS：電話番号認証用のSMSが届いているので認証用のURLを開いて完了
１１．（おまけ）safari：ログインページで１項で設定したyahooモバゲーのメールアドレスと８項で設定したログインパスワードを入力すればログインできます
※適当に再現しながら書いたので一部誤りがある可能性がありますので、ご指摘あればコメントをお願いします。
※yahooモバゲーで生年月日の設定を行っていない場合は５項で(3)を選択すれば良いような気がします。
※検証はiPhone3GS(OS4.2.1)で行いました。