中華連邦の歴代天子を奉る天帝八十八陵への篭城を余儀なくされた黒の騎士団。天子を抑えているので、攻撃をして来ないと推測。何とか事態の打開を図ろうとしていた。しかし大宦官達は、ブリタニア帝国軍に援軍を要請。天子と黒の騎士団を抹殺すべく、爆撃攻撃を開始した。更にクーデターを起こした星刻達に対し、ナイトオブラウンズのジノとアーニャが立ちはだかった。
この事態を打開すべく、大宦官達に直接コンタクトを取ったゼロ。天子への攻撃を止めるように
哀願した。しかし大宦官達にとって、天子が死んでも全く気にしてなかった。代わりの天子を既に用意し、オデュッセウスとの政略結婚を再び結ぼうとしていたからだ。更に人民の事も顧みない領土割譲や不平等条約の締結も、既に爵位を手に入れ、ブリタニアの貴族になろうとする自分達にとって、既に関係ない事だと告げた。
激しさを増す爆撃に襲われる天帝八十八陵。ついに止めさせようと天子が、斑鳩の外に出た。
その姿を見た星刻は、神虎を縦に天子を守った。しかし２人もろとも抹殺すべく、更なる攻撃を支持した大宦官達。このままでは、天子を守れないと悟った星刻。自らの命と引き換えに、天子の
救出を求めた。その言葉に呼応したのはゼロ。新たなナイトメアフレーム蜃気楼と共に登場。中華連邦の鋼髏部隊の攻撃を受け止め、逆に一斉攻撃で殲滅させた。
それと同時に中華連邦の主要都市で、人民達が一斉に暴動を発生させた。実はこの裏には、星刻達がクーデターと同時に人民達の暴動を計画していた。ゼロは、大宦官達との会話を引き金に計画を利用したのだ。暴動発生により、人民達の支持を失った事を知ったシュナイゼル。大宦官達を見放し、全軍に撤退指令を下した。後ろ盾を失った大宦官達は、命乞いをしたが、星刻の剣によって裁きを受け、中華連邦での戦いは決着した。
その後天子との政略結婚を進言したディートハルト。天子の気持ちを知っていた神楽耶は、反対したが、ゼロは政略結婚の相手の人選を考えて始めた。しかしシャーリーからの電話で、人を
想う力の凄さを訴えられ、ルルーシュ自身もナナリーの事を想って行動してる事を再認識。政略結婚ではなく、天子の意志を尊重する決断を下した。そしてＣ．Ｃ．に次なる目標である、ギアスを研究する教団の所在地を掴むように指示を出し、エリア１１に戻った。
アッシュフォード学園では、ルルーシュの不在中、変装が得意な咲世子が、影武者として行動していた。ただ必要以上に優しく接したり、秘密司令部がばれないようにシャーリーにキスをするなど、後々に問題を起こす行動をしていた。更に生徒会にナイトオブラウンズのジノとアーニャが
やって来た。フレンドリーな彼らに当惑するルルーシュ。果たして彼らの意図は？
「キスさせて頂きましたが、何か問題でも？」司令部が知られると思い、シャーリとキスをして
その場を凌いだ咲世子。他の人に良い顔し過ぎるとロロに詰め寄られるほど。ルルーシュの予測を超える行動を取っていた。「咲世子このスケジュールは？」１日のスケジュールを見せられ
驚くルルーシュ。朝７時から女の子とのデート予定が、びっしりと詰め込まれており、１０８名の
女の子と約束をしていた。（いくらフレンドリーに行動しろと言われて、１０８人とデートの約束を
しますか普通？ある意味では優秀なんですけど、一般常識が無さ過ぎる。シャーリーはキス
されて本気モードになっている所に、ルルとデートすると話す女の子達。怒るのも無理もない。
ミレイのおっぱいは、目の保養になりましたけど。）
「それでは本日のスケジュールを確認します。」咲世子が組んだスケジュールは、体力のない
ルルーシュには余りにも過酷だった。朝７時から手作りのお弁当を食べ、９時から美術館での
鑑賞。１０時３０分からショッピング。ここまでは全て女の子とデート。その後蜃気楼で中華連邦へ移動。ゼロの衣装もコックピットにありそこで着替えた。１５時より上海にて、インドとの通商条約の締結をした。滞在時間わずか４７分。その後再びトウキョウ租界にとんぼ帰りして、２１時
より再び女の子と映画館のレイトショー！２４時２分にライブハウスで待ち合わせ。それを全て
こなし、ようやく帰って来た時には、体力は無いに等しかった。（めちゃくちゃなスケジュールですけど、蜃気楼は上海まで本当に短時間で移動可能なんですね。）
「すまないシャーリー！後で説明する時間を作るから。」学園に戻った時、独り言を言って怒る
シャーリーに言い訳をするルルーシュ。その時アーニャが、ブリタニア皇子時代のルルーシュの
写真を見せ説明を求めて来た。「嫌だな人違いですよ。俺はただの庶民で・・・・」当然写真の自分とは人違いだと返答した。それもつかの間、リヴァルから掛けチェスの話を聞いたジノが、自分も連れて行って欲しいと頼みに来た。リヴァルに怒るルルーシュ。ついには、女の子達まで集まり始め、対応に追われ始末。最後は、怒るシャーリーに突き飛ばされ「賭け事だけじゃなく、女遊びまで本当に情けない！」完全に誤解されてしまった。（お土産を渡してはいおしまいって、ルルは女の子気持ち分かっていない。天才的戦略家ですが、女の子に対する戦略は駄目駄目！）
「Ｌｏｏｋ！決めたあたしの卒業イベントキューピットの日！」生徒会のクラブハウスに現れた
ミレイ。留年中であったが、ついに足りなかった単位を取得して、卒業を決意した。「ミレイ何だよ
キューピットの日って！」説明を求めるジノ。キューピットの日とは、全校生徒が女子は赤い帽子を被り、男子は青い帽子を被る。異性の帽子を奪って被ると、生徒会長命令でその２人は、強制的にカップルになるイベント。集まった生徒達から一斉に驚きの声が上がった。（そんな学園本当にあったらもの凄いですね。もし付き合っている人がいて、他の異性に帽子を奪われたら分からなければいけないのです。いい迷惑ですよね。ロロも子供の頃から暗殺をして来て、人格破綻者なんて人の事言えないでしょ。）
一方ブリタニア帝国の帝都ペンドラゴンでは、ブリタニア皇帝から、中華連邦に宣戦布告するように命じられた、皇族達が話し合いをしていた。穏便に事を済ませたいオデュッセウス。戦争に賛成するギネディアとカリーナ。意見は２つに分かれていた。「モンゴル省との国境沿いに師団を揃えよう。戦闘行為は必要ないよ。今の中華連邦はバラバラだ！思惟行為と交渉だけで領土の半分は手に入る。」部隊を揃え中華連邦を威嚇。交渉によって、バラバラな中華連邦の領土を奪い取る事を宣言したシュナイゼル。「戦争など愚か者のやる事よ！」ナイトオブワンのビスマルクから報告を受けたブリタニア皇帝。戦争ではない方法で、中華連邦の領土を奪い取る事を
認めた。（また新しいキャラが出て来ました。お姉様がギネディア。ナナリーと仲が悪い女の子がカリーナです。確かに戦争ではない行為で、領土を奪い取れれば楽ですよ。）
そしてブラックリベリオン後姿をくらませ、ギルフォードにも連絡していなかったコーネリア。中華連邦内にある「ギアス嚮団」に単身潜入していた。「捕えたぞギアスの尻尾を！必ず日の当る場所に引きずり出し、ユフィの汚名をそそいでやる。」ギアスの正体を掴み、それを白日の下に晒し、虐殺皇女の汚名を着せられた、ユーフェミアの汚名を晴らそうとしていた。（ギルフォード卿はコーネリア様命ですから、心配で仕方ないでしょう。写真を眺めて思い出に浸るというのは何よりの証拠です。それにしてもカレンの前に現れたナナリーの意図は？）
キューピットの日当日、ルルーシュ達は司令室で作戦会議をしていた。「キューピットの日を
使って、女との関係を一気に清算する。ヴィレッタに俺の帽子を取ってもらう。」咲世子が、デート
の約束をした女の子を見ながら、ヴィレッタに帽子を取ってもらう作戦を考案したルルーシュ。「変な誤解を招くだろう。咲世子に責任を取ってもらえば。」教師と生徒では問題があり、元凶になった咲世子に帽子を獲らせる事を進言したヴィレッタ。ただ咲世子は、途中で入れ替わるので
それは不可能。結果候補として上がったのはシャーリー。ルルーシュを守る為、ヴィレッタを撃った事もあるのでゾッコンなのは間違いない。「もう巻き込みたくないんだ！」再び危ない橋を渡らせたくない思いが、ルルーシュにはあった。（シャーリーは、そうは思わないはずですよ。また
ルルがピンチになったら、何でもすると思ったんですけどね・・・・・・）
「それではキューピットの日を開始します。スタートの前に私から一言！３年Ｂ組ルルーシュ・ランペルージの帽子を持って来た部の予算を十倍にします！」一通りのルール説明が終わった後
ミレイが、ルルーシュの帽子を持って来たら予算を十倍にする、仰天発表をした。これにより各部から狙われる事になったルルーシュ。いよいよ花火が上がりキューピットの日が始まった。開始同時と共に、学校全体にロロがギアスを掛けた。狙われたルルーシュを救い出す為に。（ロロお前利用されているだけなんだぞ！最後はボロ雑巾なんだぞ！いいのかそんな事をして？あっミレイが言っていたモラトリアムとは、社会的責任を問われない猶予期間の事です。留年なんて
まさにうってつけです。でもスザクをリラックスされる一言もちゃんと言えるし、もの凄く好きなキャラクターですね。）
「ジノは本当に学園に遊びにだけのようだな。アーニャは、俺の素性を疑っているようだが、そのレベルでは問題は無い。ナイトオブラウンズの問題はクリアーされた。」ジノとアーニャについての問題がクリアーされ、１人図書館を歩くルルーシュ。ルルーシュに恋するミーヤに帽子を獲られたが「ミーヤ君帽子を返してくれないかな？」ギアスを掛け、簡単に取り返した。その後影武者の咲世子と交代して、司令室に戻った。「こちらラグビー部、ルルーシュを発見！」見失った
ルルーシュを発見した事を報告され「全部活に通達！中庭に集まりルルーシュを囲みなさい。」
指示を出すミレイ。しかしルルーシュは、既に咲世子に入れ替わっていた。ラグビー部員の突進も超人的なジャンプ力でよけた。（確かに「トゥ」なんていったら、人格疑われる！咲世子さんはいいのかもしれませんけど。それにしても三宅ひとみちゃんは、もの凄い棒読みでした。あれでＯＫ出るって本当に酷いな。）
この後もミレイが、送り込む科学部の攻撃をジャンプでかわし、女の子のお色気も当然の如く
通用しなかった。「全員に通達！ルルーシュを見つけ次第一斉攻撃よ！」作戦が外れ、ついに
一斉攻撃を指示したミレイ。しかし何を勘違いしてかアーニャが、モルドレッドで出撃。まさかの
事態にブリタニア政庁は「暴動」として、学園地区にナイトポリスを出撃する騒ぎに発展した。（いきなりモルドレッドとは、これは笑いました。誰がなんと言おうと駄目です。）
「咲世子は、図書館へ！作戦は最終局面に入る。」司令室から出て、咲世子と入れ替わろうと
したルルーシュ。図書館にはシャーリーがいて、ルルーシュを探していた。更に２つの熱源反応を認識したアーニャが、間違えてシャーリーに襲い掛かった。「危ないシャーリー！」咲世子の化けたルルーシュをアーニャに見られてしまったが、間一髪現れたルルーシュが救出した。但し勢い余って階段から転げ落ちてしまった。（アーニャにルルが２人いる事がばれた。今後何もなければいいのですけど！）
シ「ねえルルどうして私にキスをしたの？」
ル「それは好きだから！」
シ「嘘、本気じゃないくせに。」
ル「違う！俺はその・・・・どうしてだろう？」
シ「ねえキスの先もしたい？いいよ嘘のキスでも私・・・・」
ル「駄目だそんなの！」
シ「ルルに戻った？」
実はルルーシュの様子がおかしいと思っていたシャーリー。ルルーシュの真意を確かめるべく
わざと答え難い質問をしたのだ。「元のルルに戻った。いいよ許してあげる！目をつぶって。」受け答えから、いつものルルーシュに戻った事を認識して、目をつぶらせた。それはキスの合図かと思われたが、ほっぺをつねっただけ。改めて帽子を取り本当にルルーシュを好きにさせると宣言したシャーリー。これで強制的にカップル成立！
中庭に戻りミレイは、各部活を抱き込み全てルルーシュとシャーリーの為に仕組んだ事を
白状した。「ぼやぼやしてると学生終わっちゃうよ。」あまりにももどかしい２人だったから、最後にカップルにさせたという訳だ。「会長ありがとうございました。ご卒業おめでとうございます。」
シャーリーやスザクからお祝いとお礼の言葉を掛けられ、ミレイはアッシュフォード学園から卒業した。（婚約を解消して、自らの力でお天気キャスターとして出発したミレイ。アッシュフォードの家ではなく、自らの力で歩くとニーナに誓いを立てるように！）
晴れてカップル成立したルルーシュとシャーリー。しかしジェレミアが動き出していた。Ｖ．Ｖ．から与えられた「ギアスキャンセラー」というギアス効力を無効化する力を手に入れ、ギアスをかけられたＳＰを探し出していた。そしてギアスキャンセラーにシャーリーが掛かってしまった。ギアスで、忘れさせられていた記憶が蘇り「思い出した！お父さんを殺したゼロはルルーシュ！」雨の中ゼロがルルーシュだと思い出してしまった。ルルーシュを狙うジェレミアと記憶を思い出して
しまったシャーリー。どうやらブリタニア皇帝が、記憶を変えたみたいですね。新たな難題が、ルルーシュに襲い掛かりそうです。
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