rel="nofollow"というのはHTMLの言語で
”リンク先にページランク等の受け渡しはしない"
といった意味でよく使われます。
Googleなどの検索エンジンは故意に検索順位を変動させる
ことを目的としたリンク設置を禁止していますので、
広告などのリンクに対しrel="nofollow"の設置を勧めています。
ブログでもコメント欄からのリンクにはrel="nofollow"が付けられることが多く、
それは有名人などページランクの高いページのコメント欄に、
自分のページへのリンクを張ることで、
上位表示させることができないようにするためです。
ただ、だからと言って全く意味はないのでしょうか？
確かにページランクによる効果はないにしても、
リンク先のページとリンク元のページの内容の把握や、
キーワードによる効果はあると考えられます。
なのでrel="nofollow"だから関係ないとは思わずに、
自然リンクであればいろんなサイトからリンクを集めて、
クローラーに対しての出現率を上げることが重要であると思います。