今回の旅行で、トラブルも有りたまたま車でボストン→ニューヨークを２往復することが出来たので、以下、簡単な考察です。
まずボストン→ニューヨークですが、ルート90（ターンパイク：1.75ドル）→ルート84でHartfordに向かい、ルート91で南下します。
ここまでは議論の余地がないと思いますが、
1. そこからルート91までNew Havenに向かってルート95でロングアイランド湾沿いを走行
2. ルート91の途中（Meriden）でルート15へ行き、そのまま西に進みWhite Plainsを経由して行く
上記2通りがあると思います。
1. の場合、ルート95は渋滞することが多い印象です。
2. は私自身、まだ試していませんが、ニューヨークへ頻回に行っている同じラボの日本人Mさんによると、ルート15はトラックも少なく渋滞の頻度が低いそうです。
（確かにルート15は No comercial Vehicleと書いていました）
次回は私も2. をトライしてみようと思います。
（ナビを使用していると自動的にルート95へと誘導されるのでMeriden付近で注意して進路を変更する必要がありそうです。
さらにニュージャージーのミツワに行く場合、新たなルートを考える必要があります。
ハドソン川を越えてNJに行くのですが、ナビを使用していると通常、George Washington Bridgeを案内されます。しかし巨大な橋ですが、トラックの数が尋常ではなく、入口付近はいつも渋滞しています。
さらに行き（NYC→NJ）は無料ですが、帰りは橋を渡るのに13ドルかかります。
そこで私は、北側にあるもう一つの橋である、Tappan Zee Bridgeを使用しました。
この橋もNYC→NJは無料であり、NJ→NYCは5ドルと割安です。
さらにトラックの数も少なくスムーズにルート15もしくはルート95に接続されます。
やや遠回りとなりますが、所要時間はむしろ短い印象です。
もし他に良いルートをご存知の方がいれば是非教えて下さい。