映画「劇場版 奥様は、取り扱い注意」のネタバレを含んだあらすじを紹介します。
穏やかな日常
特殊工作員の伊佐山菜美は中央アジアのアジトで激しい銃撃戦を繰り広げます。
しかし、彼女はロシアの諜報員ドラグノフによって捕らえられ、一触即発の状況に追い込まれます。
菜美は巧みな戦術を駆使してドラグノフに反撃しますが、重傷を負いながらもヘリコプターで脱出します。
一方、地方都市の珠海市では、専業主婦の桜井久美が穏やかな日々を過ごしています。
彼女は夢の中で時折、過去の出来事を思い出すが、その意味が分からずにいます。
久美の夫である裕司は高校教師であり、二人は穏やかな日常を過ごしています。
メタンハイドレート
珠海市では、メタンハイドレートの採掘計画が進められており、その是非を巡って市内は意見が割れています。
市長の坂上洋子は採掘賛成派を率いており、これに対抗する「珠海の自然を守る会」も結成されています。
近く行われる市長選では、現職の坂上市長に加え、反対派の五十嵐晴夫が立候補することが決まっています。
一方で、メタンハイドレートの研究者である北原教授が失踪しており、その背後には何かが潜んでいるようです。
さらに、「珠海の自然を守る会」の事務所に侵入する事件も発生し、市内の緊張感が高まっています。
過去の記憶
18ヶ月前、伊佐山菜美は夫の勇輝と穏やかな日々を送っていました。
しかし、勇輝は警視庁警備局公安部の人間であり、菜美を密かに監視していました。
その監視の中で、菜美と勇輝はお互いの正体を知ることになり、勇輝が菜美に銃を向けて発砲します。
しかし、その銃撃は菜美ではなく家に侵入していた外国人工作員に命中していました。
菜美と勇輝は協力して工作員たちと戦い、菜美は負傷しますが、一命は取り留めました。
しかし、その負傷により菜美は過去の記憶を全て失ってしまいます。
高校教師の“桜井裕司”
勇輝は新たな任務として、珠海市沖のメタンハイドレートの調査を行うグローバルマネーホールディングス社の不正な金の流れを調査するよう命じられます。
彼は高校教師の“桜井裕司”として潜入し、菜美も同行させられます。
しかし、池辺から菜美が協力しなければ始末するよう命じられたことを知ります。
一方で、グローバルマネーホールディングス社の社長・浅沼信雄はロシアにメタンハイドレートの調査費を横流ししており、北原教授が残したデータの回収や坂上市長の再選を目論んでいます。
採掘反対派も暴力や不可解な事件に襲われており、菜美も事故に巻き込まれますが、彼女を助けた岩尾珠里という男と出会います。
勇輝は公安の神岡恭平から、反対派に潜入するよう命じられました。
一方、久美（菜美）は岩尾の招きで、彼が経営するダイニングバー「Change」に訪れ、将来の夢について語りました。
岩尾はコスプレを趣味としており、久美も彼の店で新たな趣味を見つけることになります。
将来の夢
帰宅後、久美は自分の将来を描きました。
海の見える丘にカフェを構え、裕司（勇輝）と子供たちと楽しく過ごす日々を夢見るのです。
その後、岩尾から網元料理を学び、彼の店で手伝いをするようになります。
久美は裕司（勇輝）に、以前描いた夢の絵と同じ海の見える丘に連れて行ってもらい、将来の店の名前を「Mar de Memories（マール・デ・メモリーズ）」と決めました。
久美（菜美）はある日、五十嵐がチンピラに襲われている場面に遭遇し、彼を助けようとします。
しかし、彼女自身も被害に遭い、その際に記憶が突如として戻りました。
裕司（勇輝）が現れて二人を助けた後、久美は裕司に自分の記憶が戻ったことを秘密にすることを決意します。
彼女は「過去を捨てて、今を大切にしたい」と勇輝に告げ、彼もまた「君は君のままでいい」と応えました。
黒ずくめの人物
五十嵐は市長選への立候補を躊躇するほど、度重なる妨害に悩まされています。
しかし、警察の対応は十分ではなく、浅沼と横尾はドラグノフを呼び寄せるなど、非情な手段に出ています。
一方、久美は岩尾の店で大人気の存在となっています。
同時期に、反対派を襲撃しようとしたチンピラたちが黒ずくめの謎の人物によって撃退されていました。
この情報を聞いた勇輝は、その人物が女性ではないかという噂を耳にし、菜美が関与しているのではないかと疑い始めます。
一方、帰宅した久美はテレビで、心臓や血管が無事だったにも関わらず、鉄筋が胸に貫通している人物の特集を見て感心していました。
岩尾が黒ずくめの人物であることを目撃した勇輝は驚きました。
以前は矢部の教え子であった岩尾が、横尾に買収されたという情報を勇輝に伝えました。
将来の店のイメージ
その夜、矢部から北原教授のデータについての話を聞いた勇輝は驚愕します。
データには、メタンハイドレートが10年で枯渇するという重要な情報が含まれており、これが賛成派にとって非常に有利な情報でした。
データが調査船に隠されていることが判明し、勇輝はそれを手に入れるために行動を開始します。
翌朝、勇輝は久美を連れて海の見える丘に行きました。
久美は自分が考案した店のロゴを地面に置き、将来の店のイメージを具現化しました。
出航記念パーティー
その夜、勇輝は外国人工作員に取り囲まれ、彼らによって久美を殺すか、自らデータを持ち出すかの選択を迫られます。
調査船が出航する前日、船内では出航記念パーティーが開催されました。
坂上市長や横尾らも出席し、パーティーには船に乗る乗組員だけでなく、一般市民も招かれていました。
パーティーの中、矢部と一緒に船内に潜入した勇輝は、データの隠し場所を探し始めました。
同じ頃、久美（菜美）は三枝のセラピーを受けていました。
その時、菜美の元に謎の電話があり、ロシア語で「大事な人を殺してやる。お前も苦しめるぞ」と脅されました。
菜美は即座に警戒し、公安の者たちが接近していることを感じ取ります。
慌てて対応し、公安の者たちとの激しい戦闘の末、菜美は結婚指輪を捨てて調査船に向かう決意を固めました。
開発計画書への署名
調査船内ではデータを見つけ出した勇輝が外国人工作員たちに取り囲まれています。
工作員たちは菜美を誘き出すために勇輝を利用しようとしています。
そこへ、黒のスーツに身を包んだ菜美が現れ、勇輝に記憶を取り戻していることを告げます。
二人は団結し、工作員たちとの壮絶な戦いに挑みます。
その時、矢部は坂上市長に会い、勇輝がデータを回収するために向かっていると告げ、採掘の中止を懇願した。
しかし、そこに現れた横尾は坂上市長に開発計画書への署名を迫り、二人を拘束した。
しかし、矢部と坂上市長は隙を見て逃走した。
愛しているなら、私を撃って
菜美と勇輝、そして工作員たちとの戦いで手榴弾が使用され、爆発音が響く中、来客たちは次々と逃げ出していった。
菜美と勇輝はドラグノフとの激しい戦いに挑み、菜美はドラグノフとの死闘の末、採掘用の巨大なやぐらのエレベーターで格闘しながら頂上にたどり着いた。
菜美がドラグノフを気絶させた直後、階段を上ってきた勇輝が菜美を制止しようとすると、突然、神岡が現れ、ドラグノフを撃った。
神岡は以前から菜美の動向を監視しており、「ロシア人（ドラグノフ）に情報を漏らして浅沼を上手く仕留めた」という共犯関係を提案したが、菜美は「私はあなたをおびき寄せるための囮だった」と拒否します。
やぐらには池辺や公安の者たちが駆けつけ、神岡を取り押さえました。
実は神岡は複数の敵に情報を漏らしており、ドラグノフと浅沼を手玉に取っていたのだった。
池辺は公安の部下に、菜美を捕まえるよう命じた。
しかし、菜美は勇輝を人質に取り、「今の私のことを愛している？」と問いかけ、「愛しているなら、私を撃って」と銃を渡した。
勇輝は「愛している」と答え、菜美の胸を撃った。菜美は海へと転落してしまいます。
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